A Floresta Atlântica é um importante ecossistema encontrado na costa brasileira. Seu processo de fragmentação vem reduzindo-a a pequenas ilhas verdes, que merecem atenção especial através de pesquisas e trabalhos que visem sua conservação.

O Zôo de Salvador possui uma exuberante e bela área de Mata, que funciona como verdadeiro laboratório vivo abrigando exemplares vegetais representantes da Mata Atlântica, tais como Sapucaia, Sucupira e Pau D' arco e plantas exóticas como Jaqueiras e Mangueiras. Além de plantas, existem vários animais silvestres, nativos, como Sagüi-do-Nordeste, Tamanduá-Mirim, Preguiça, Cutia e exóticos como Mico-de-cheiro amazônico e o Veado-Sambar africano. A Mata além de ser um instrumento de Educação Ambiental e local de pesquisa, funciona como uma Área Verde de equilíbrio ambiental.