No Horto do Zôo existem coleções de plantas vivas, ordenadas e identificadas, com finalidades conservacionistas, educativas e paisagísticas.

Originalmente concebido como Orquidário o Horto do Parque Zoobotânico funciona como um local de produção de mudas em uma área 950m². Dentre as espécie nativas lá encontradas destacam-se algumas ameaçadas de extinção, entre elas o Jacarandá-da-Bahia e o Pau-Brasil,e outras exóticas de grande valor paisagístico como a palmeira-Imperial e a Castanha-de-Macaco. Nele também são produzidas várias plantas ornamentais, como bananeiras silvestres, bromélias e cactos, utilizadas no paisagismo do Parque. É deste Horto que saem as mudas para o enriquecimento e ambientação dos recintos e embelezamento do Parque.