O meio ambiente atual é resultado do processo de desenvolvimento sócio econômico da humanidade, que vem modificando os ambientes naturais, levando, consequentemente, à extinção diversas espécies animais e vegetais. Diante deste quadro, foi percebido que educar a sociedade global deveria ser a atividade mais sensata na busca de alternativas para solucionar os problemas ambientais da atualidade.

Com o objetivo de sensibilizar a sociedade sobre a necessidade de preservar e conservar o ambiente, o Jardim Zoológico de Salvador, desenvolve um Programa de Educação Ambiental voltado às escolas de ensino regular da rede pública e privada, e instituições especiais de ensino.

Todas as aves do Zôo são cuidadosamente monitoradas para que se conheça seus hábitos sociais e reprodutivos.

Para facilitar esse trabalho elas recebem um número, que é gravado em anel de alumínio (anilha) e colocado na pata do animal. Esta técnica, chamada de anilhamento, permite o acompanhamento individual dos animais. Quando se conhece o sexo da espécie estudada, a anilha é colocada na pata esquerda das fêmeas e na direita dos machos.

Alguns grupos de aves, como os Psitacídeos (papagaios, araras e periquitos), não possuem dimorfismo sexual, ou seja, características físicas que difereciam machos de fêmeas. Para identificar os sexos dessas aves se recorre à técnicas modernas, como o exame de DNA, que facilita o pareamento correto e viabiliza a reprodução em cativeiro. Um dos bons resultados das pesquisas que vêm sendo desenvolvidas no Zôo foi o nascimento,ocorrido em 1998, em Janeito e Fevereiro de 2001, de urubu-rei (Sarcoramphus papa), espécie ameaçada de extinção e inserida no plano de reprodução em cativeiro do Zôo.
Observa-se na área do Zôo uma rica avifarma, como pássaros canoros, psitacídeos, gralhas, aves de rapina, aves migratórias (em períodos sazonais) dentre outras.